Новый вариант коронавируса: вот что учёные знают о B1525

Вариант коронавируса под названием B1525 стал одним из самых последних дополнений к глобальному списку наблюдения за вариантами и был включен в список вариантов, расследуемых Общественным здравоохранением Англии.

Учёные внимательно следят за этим вариантом, потому что у него есть несколько мутаций в гене, который отвечает за синтез спайкового белка – часть вируса, которая цепляется за человеческие клетки. Эти изменения включают присутствие всё более известной мутации под названием E484K, которая позволяет вирусу частично уклоняться от иммунной системы, и обнаруживается в вариантах, впервые идентифицированных в Южной Африке (B1351) и Бразилии (P1).

Хотя нет информации о том, что это означает для B1525, появляется всё больше свидетельств того, что мутация E484K может повлиять на эффективность вакцин против COVID. Но пока нет никаких предположений о том, что B1525 более заразен или что он приводит к более тяжёлому заболеванию.

Есть и другие мутации в B1525, которые также заслуживают внимания, такие как Q677H. Учёные неоднократно обнаруживали это изменение – по крайней мере шесть раз в разных вирусных линиях в США, предполагая, что это дает вирусу преимущество, хотя природа какого-либо преимущества ещё не определена.

Вариант B1525 также имеет несколько делеций – где «буквы» (G, U, A и C) вирусной РНК отсутствуют в его геноме. Эти буквы также отсутствуют в B117, варианте, впервые обнаруженном в Кенте, Англия. Исследования Равиндры Гупты, клинического микробиолога из Кембриджского университета, показали в лабораторных экспериментах, что эти делеции могут вдвое увеличить инфицирующую способность.

Появился недавно

Как и многие другие варианты, B1525 появился совсем недавно. Самый ранний образец в общей глобальной базе данных геномов коронавирусов под названием Gisaid датируется 15 декабря 2020 года. Он был обнаружен у человека из Великобритании. И, как и многие варианты, B1525 уже путешествовал по миру, прежде чем привлек всеобщее внимание. В общей сложности 204 последовательности [нуклеотидов в молекуле ДНК] этого варианта в Gisaid можно отследить в 18 странах по состоянию на 20 февраля 2021 года.

На две страны (Дания и Великобритания) приходится более половины случаев, но эти две страны также секвенируют большое количество геномов коронавируса.

Другими странами, которые внесли хотя бы один геном этого варианта в онлайн-базу данных, являются Нигерия, США, Франция, Канада, Гана, Австралия, Япония, Италия, Нидерланды, Иордания, Сингапур, Финляндия, Швейцария, Майотта, Бельгия и Испания.

25 февраля Ирландия сообщила о своем первом случае B1525.

В общей сложности 31 геном B1525 был представлен в Gisaid Нигерией. В заявлении от 19 февраля 2021 года о вариантах коронавируса из Нигерийского центра по контролю за заболеваниями сообщалось, что первый обнаруженный геном B1525 был из образца, взятого 23 ноября 2020 года у пациента в штате Лагос, но образец не был немедленно добавлен в базу данных, следовательно, британский образец является первым зарегистрированным. Пока этот вариант выявлен среди заболевших в пяти штатах Нигерии. Случаи B1525 также были зарегистрированы в других странах у путешественников из Нигерии. Так что мутация, возможно, впервые появилась в Нигерии.

Знание того, является ли определённый вариант распространённым среди населения, полезно для общественного здравоохранения и принятия политических решений.

Различная частота встречаемости

Другой способ определения частоты конкретных вариантов [вируса] – определить, насколько часто они встречаются по сравнению с другими вариантами, находящимися в обращении одновременно. Если посмотреть на частоту эпизодов B1525, обнаруженных с момента обнаружения первого экземпляра этого варианта в этой стране, выявляется иная частотная закономерность.

В Дании по состоянию на 20 февраля 2021 г. на него приходилось 59 из 12 222 [вирусных] последовательность оснований [в ДНК]; в Великобритании 57 из 100 063 последовательностей; а в Нигерии – 31 из 144 последовательностей. Это говорит о том, что этот вариант, вероятно, довольно распространён в Нигерии, но редко в Дании и Великобритании. Отсутствие данных о [вирусной] последовательности может скрывать частоту в других странах. Однако такие расчёты могут быть необъективными, если вирусы, выделенные от путешественников, с большей вероятностью будут секвенированы.

Какой бы способ мы ни выбрали для измерения частоты B1525, на данный момент он остаётся редким вариантом. Но он присоединяется к растущему списку вариантов коронавируса, которые необходимо подробно изучить в лаборатории и у инфицированных людей, чтобы выяснить, стоит ли нам беспокоиться об этом варианте, и если да, то где он находится в таблице лидеров вариантов, чтобы наблюдать и вовремя реагировать.

источник https://theconversation.com/new-coronavirus-variant-here-is-what-scientists-know-about-b1525-155388

редактура и адаптация Дмитрий Бобров